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大峡谷州立大学Annis水资源研究所的兼职研究助理Molly Lane说, 11月9日,他与名为BIO-RAD自动液滴发生器的新研究设备合影, 2020.
格兰谷州立大学兼职研究助理莫利·莱恩 该大学的Annis水资源研究所,与一个新的 一种叫做BIO-RAD的自动液滴发生器 2020年11月9日.
图片来源:Kendra Stanley-Mills

大峡谷州立大学的Annis水资源研究所 (AWRI)和细胞与分子生物学(CMB)部门正在合作 在密歇根州的试点研究中实施测试 监测和检测废水中新型冠状病毒肺炎病毒遗传标记的方法.

GVSU的这项研究是密歇根州仅有的17项研究之一 国家环境,大湖和能源部(EGLE) 使用“数字液滴聚合酶链反应”或ddPCR 测量废水中新型冠状病毒肺炎的方法. GVSU的助学金是 31.8万美元用于进行试点研究,另外还有20万美元用于购买设备.  

检测很重要,因为发现病毒“标记”或 废水中的残留物可以帮助跟踪大流行的进展 人群和确定潜在的疫情. 据里克说 Rediske,水资源学教授和首席研究员 AWRI,这是因为许多人开始感染COVID 在他们的排泄物中“脱落”病毒标记长达一周 他们表现出或经历症状.

大峡谷州立大学的研究员Rick Rediske说, 他是该大学Annis水资源研究所的环境化学家, 11月9日在AWRI拍摄的, 2020.
格兰谷州立大学的研究人员里克·雷迪克是一名环境学家 图为该大学Annis水资源研究所的化学家 于2020年11月9日在AWRI举行.
图片来源:Kendra Stanley-Mills

“这项测试使我们能够制定基线并提供数据 到全州的卫生部门,”雷迪克说. "We 将测试来自马斯基根县和渥太华县的废水样本, 包括提供校内和校外住宿服务的地点 艾伦代尔. 它可以帮助我们判断疫情是否会在出现病例之前爆发 报告."

Rediske说,EGLE的拨款是1000万美元预算的一部分 该项目允许研究人员使用新的ddPCR检测来发现 微小样本的每个液滴中都有病毒标记. Rediske说, 使科学家能够很好地稀释干扰并得到结果 快速准确. 

Rediske的实验室一直在使用传统的定量PCR检测 监测密歇根湖海滩的水 质量 几年来,把AWRI放在了该州的雷达上,以进行这种性质的项目.

新的ddPCR检测方法是“最先进的”。 下一代技术,Rediske说. 这种新仪器被称为a BIO-RAD自动液滴发生器ddPCR,可以取浓缩液 废水样本小于1毫升,并将其分解成1.5万份 然后对每个液滴中的病毒标记进行分类和测量.

BIO-RAD自动液滴发生器是GVSU的一种新型研究设备&他是密歇根州马斯基根市安妮斯水资源研究所(Annis水资源研究所)的研究员.
图片来源:Kendra Stanley-Mills
BIO-RAD自动液滴发生器是GVSU的一种新型研究设备&他是密歇根州马斯基根市安妮斯水资源研究所(Annis水资源研究所)的研究员.
BIO-RAD自动液滴发生器是GVSU的一种新型研究设备&他是密歇根州马斯基根市安妮斯水资源研究所(Annis水资源研究所)的研究员.
BIO-RAD自动液滴发生器是GVSU的一种新型研究设备&他是密歇根州马斯基根市安妮斯水资源研究所(Annis水资源研究所)的研究员.

测试将于下周开始,等待离心机的到来, 从原始废水中提取样品需要什么. 教师 来自CMB项目的成员和学生将使用该项目的实验室 在大急流城的库克-德沃斯健康科学中心处理 样本由专业人士从校内和校外地点收集. AWRI的教师和学生将处理和测试这些样本 利用大学Annis水资源的ddPCR仪器 马斯基根湖研究所. AWRI还与 马斯基根废水管理系统的样本收集. 

“到目前为止,专家们所看到的是病毒标志物的上升 Rediske说:“在报告疫情爆发之前,我们需要处理废水。. “这 作为早期预警系统. 我们可以瞄准敏感区域,比如 人口密度比其他单位高的GVSU住房单元 渥太华县地区."

莫利·莱恩和亚历克西斯·波特在大峡谷的Annis水资源研究所研究一种新设备.
格兰谷州立大学兼职研究助理莫利·莱恩 该大学的Annis水资源研究所(左)与 亚历克西斯·波特,右,带着新的研究设备BIO-RAD 自动液滴发生器. 波特是公共卫生硕士 流行病学的候选人.
图片来源:Kendra Stanley-Mills

这项联合努力还将检测服务不足地区的样本 马斯基根县的社区可能无法及时获得 保健和检查.

“我们正在努力找出口袋来帮助保护人们 对抗这种致命疾病,”雷迪克说. “这很重要 项目,因为我们需要资源来应对这一流行病 大学拥有不一定的技术能力 可在商业实验室使用. 

"It's a kind of scientific national guard; we are equipped to 通过分享我们的研究和专业知识来应对大流行. 它 反映出我们有PCR的技术和经验 监控和我们教师的专业知识. 这是一个很好的杠杆作用 大学人才与经验.”

所有从事样品和测试的教职员工和学生 将使用由拨款基金提供的专用工具和资源, 作为典型的课堂实验材料不能使用,也没有人 会接触到活病毒吗. 有一个健全的、经过批准的安全计划.

这些数据不仅会提供给地方和州当局, 但也将与疾病控制中心分享 疾控中心流行病学家的分析. 

“我们的学生正在获得最前沿的现实经验 技术和公共卫生问题,” Rediske说. “我们很自豪能够提供我们的专业知识和 我们的教职员工和学生的能力,以努力提高公众 面对新型冠状病毒肺炎的健康."

大峡谷大学有很多教师和学生从事这方面的工作 项目,包括:

  • AWRI

Richard Rediske,首席研究员

Charlyn Partridge,联合首席研究员

Kevin Strychar,联合首席研究员

莫利·莱恩,研究助理

布莱恩·斯库尔,实验室经理

玛吉·彼得森,生物学硕士生

亚历克西斯·波特公共卫生硕士

  • 细胞与分子生物学(CMB)

希拉·布莱克曼,联合首席研究员

朱培兰,联席首席研究员

Alisha Babu, M.S. 招商银行的学生

Niranjan Pokhrel, m.s.S. 招商银行的学生

萨拉·拉赫曼,m.s.S. 招商银行的学生

法鲁克·西迪基,m.s.S. 招商银行的学生

托马斯·戈拉尔斯基,m.s.S. 招商银行的学生

奥斯汀·希恩,M.S. 招商银行的学生

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